El Albergue Juan Sebastián Elkano se encuentra ubicado a 800 m. del casco urbano de Hondarribia, en la carretera que conduce al faro de Higuer. Tiene 152 plazas distribuidas en 3 plantas en habitaciones de 2, 4 y 16 camas. El albergue pone a disposición de cada persona usuaria taquillas para depositar los efectos personales. Cuenta con comedor, salón de actos, salas de TV, DVD y vídeo, salas de reuniones, biblioteca, aulas de estudio y trabajo y lavandería.
En el exterior posee una amplia zona de recreo, que incluye una pista polideportiva de hierba artificial y un parque infantil.
Posibilidad de alojamiento y desayuno, media pensión y pensión completa.
Este albergue pertenece a la REAJ, Red Española de Albergues Juveniles, por lo que pueden utilizar sus servicios aquellas personas que dispongan de carnet de alberguista.